Obecność toksyn w wodzie najczęściej wiąże się z trzema sytuacjami. Pierwszą z nich jest obecność toksycznych gatunków sinic (cyjanobakteri), które są w stanie wydzielać truciznę do wody. Może się to odbywać zarówno w akwariach słodkowodnych jak i morskich. Toksyczne gatunki sinic zdarzają się stosunkowo rzadko w akwariach jednak należy mieć na uwadze to, że mogą one być potencjalnym niebezpieczeństwem.